耐腐蝕磁力泵的流量可采用多種方式調節，一般情況下，控制在泵的額定范圍比較合理，但有時因某種原因必須調小泵的流量，使其在流量較小時運行，會造成以下一些不利影響。
一、耐腐蝕磁力泵效率降低，功耗增加；磁動力泵在設計時，通常使效率高的點接近額定工況點。在小流量工況點運行的耐腐蝕磁力泵，運行效率下降得很快，一般情況下，同一臺泵的流量越小，效率就越低，因此，在小流量條件下運行是非常不經濟的。一般來說，此時需要重新配置適當的小型泵。
二、化工泵內部回流大幅度增加，內部聚熱增大，使泵內液體溫度升高，導致泵內發熱，影響泵內各部件的機械性能，還會使泵的汽蝕性能惡化，進一步影響泵的吸水狀況。
三、耐腐蝕磁力泵徑向力增大，使泵的轉子壓力下降。因為泵在小的流量區工作時偏離設計工況點，所以渦流室內的流體流動速度降低，但是根據三角形分析，葉輪內的流體流出速度反而增加，從而使流體不能匯合。